近3年来，电子书行业在我国发展十分迅猛。当当、京东、淘宝、豆瓣等企业都十分看好电子出版业，纷纷进军电子书市场。但事实上，电子书行业虽然看起来十分火热，但仍存在着许多看不见的问题。
尚普咨询出版行业分析师指出：电子书行业所面临的挑战比传统出版行业更加复杂。
电子书行业面临的最大挑战来自其本身的运作方式。首先，电子书应该如何定价。目前，当当，京东等网站都纷纷参考国外网站定价，如亚马逊等，以便达到低价吸引消费者的目的。但就算电子书的价格是纸质书价格的十分之一，消费者貌似也并不买单。一本电子书要想获得销量，前提是必须有好的作品。而且，一般来说，新书的价格是最高的，在上市之后，书的价格会随着时间的推后而渐渐下跌。这无形当中要求作者必须在短时间内写出极有销量的作品，否则，电子书将不会拥有太多销量。而且，目前中国的版权尚不完善。在许多论坛、网站上，读者甚至可以免费得到完整的书稿，在这样的情况下，读者更愿意在网上找免费的文档而愿花钱购买正版电子书。
其次，各大电子书网站的销售方式也使得电子书销售量一直不温不火。亚马逊公司的销售不仅仅局限于线上，更多的是全方位的销售模式，亚马逊公司所扮演的角色不单只是销售商那么简单。在线下，亚马逊公司开发出了Kindle电子书浏览器，牢牢抓住读者。而且，通过网络平台，直接与作者和出版社取得联系。从前到后，将读者、商家和作者紧密联系在一起。而与之相比，当当、京东的销售方式则比较单一，基本上还处于线上销售的模式。而且，电子书的加工成本巨大，销售额往往赶不上投资金额。据统计，2011年—2012年期间，当当的销售额为300万，但其投资的金额为400万，许多电子书商家都表示，电子书生产成本过高已经成为了电子书行业的一个巨大压力。
据尚普咨询发布的《2013-2017年中国数字杂志电子书刊行业分析调查研究报告》显示：中国电子书市场仍处于起步阶段，未来有很大的发展空间，但目前这一行业所面临的生产成本过大、销售方式单一等问题已经成为了该行业发展的制约因素。各大电子书生产商应该尝试改变单一的销售结构，将线上和线下产业同时发展起来。通过电子平台，将读者、销售商、作者直接联系起来，形成多方位的立体发展模式。
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