吴江农村商业银行前身是吴江市农村信用合作社联合社,源自20世纪50年代。
1996年3月,与农业银行脱钩独立运作。
1999年6月,对松陵、平望、震泽、盛泽和东方丝绸市场等五家城市信用合作社实行归口管理。
2000年10月,将全市的信用社合并成一个法人,管理上实行“统一法人、授权经营、分级核算、单独考核”。
2001年11月,经人民银行和外汇管理局批准,在江苏省农信系统中率先设立了国际业务部,开办外汇业务。
2002年12月,实行理事长和主任分设。
2003年,根据国务院《深化农村信用社改革试点方案》精神,吴江农村信用合作社联合社成为全国深化农村信用社改革中首批组建股份制农村商业银行的试点单位。
2004年8月13日,经中国银行业监督管理委员会批准开业。
截至2013年底,全行下辖40个支行、26个分理处、1个总行营业部,内设董事会办公室、监事会办公室、行政管理部、人力资源部、监察保卫部、风险管理部、法律合规部、信贷资产管理部、授信审批部、计划财务部、运营管理部、审计稽核部、科技信息部、国际业务部、电子银行部、公司银行部、零售银行部、金融市场部18个总行职能部门,并设有1个区域管理总部。